1964年暑期，凤阳农专的专科学生全部毕业分配。根据省委决定，停办专科，恢复凤阳农校，改招“半农半读，社来社去”的中专学生，专科建制不变。1965年4月初，安徽省负责文教的副省长李凡夫和安徽农学院党委副书记张佐文来凤阳农校考察，视察了校园、农牧场和兽医院，回省后决定将安徽农学院畜牧兽医系下迁凤阳，与农校合并办学。7月27日牧医系师生来到凤阳。暑假后新学年开始，各项工作纳入正轨。安徽农学院总部于1968年11月下迁凤阳，凤阳分部的农科、牧科和机关党政干部分别与农学院的农学系、牧医系和机关部门，对口合并融为一体。

1970年，安农总院又从凤阳迁到宿县紫芦湖，原凤阳农校农科随农学系和原安农机关大部分同志亦去紫芦湖；牧医系留凤阳，机关少数同志在凤阳留守。1972 年春，成立安徽农学院凤阳分院，慈惟纪、谷儒珍、刘国风负责分院领导工作。系校合并经历了17年，直至安农畜牧兽医系于1981年迁回合肥，原农校牧科教师和原凤阳农专的党政机关干部、工人、原安农下迁的少数干部及凤阳分院期间新参加工作的部分干部、教师留下，与安徽农学院淮北分院合并，独立建院。（图片来源：校史馆 审核：胡文靖 编辑：李锦）